Carlos, ¿podrías ilustrarme sobre los problemas? En cuanto al barrido de aire, entiendo que te refieres a que no llegue suficiente caudal a la estancia más alejada. Si fuera así, creo sería cuestión de limitar la velocidad mínima del ventilador.
Me refiero a que la rejillas por ejemplo estarán dimensionadas para conseguir cierto alcance con la vena de aire con el caudal nominal del fan-coil, si lo bajas esto va a cambiar y el sistema puede salirse del punto de diseño. También existe el problema de la deshumectación que te he dicho yo mismo y @mbc